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铁线莲女萎的耐热转录组分析

利用转录组测序对耐热的铁线莲种质资源女萎的耐热机理进行了研究。使用RNA-seq技术对常温(25℃)和高温处理(40℃)的样品进行高通量测序,每个处理3个重复,共获得61,708个unigenes,其中36,447unigenes(59.06%)获得注释。以高温处理和对照处理差异表达倍数超4倍进行筛选,共获得2787个差异表达的基因,其中1532个基因上调表达,1255个基因表达下调,其中热激蛋白有38个,占所有差异表达基因的1.4%,且全部上调表达,为女萎在高温胁迫下上调响应基因最多的基因家族。差异表达基因GO富集分析表明“代谢过程”、“细胞过程”和“单个有机体”是响应热胁迫的前三大功能术语。KEGG富集分析发现“蛋白加工代谢途径”,“苯丙素生物合成”和“次生代谢产物的生物合成”为显著富集的代谢通路。在上调表达基因中,热休克因子和热休克蛋白,特别是小热休克蛋白在热应激下特别丰富。本研究将有助于阐明铁线莲的热胁迫反应的分子事件(图7,Gao et al.2017, DNA and Cell Biology)

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